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    昇思MindSpore蛋白质结构预测模型全球竞赛第一

    2022年04月22日 11:08   来源:中国经济网   

      中国经济网北京4月22日讯 (记者 王惠绵) 华为全场景AI框架昇思MindSpore开源已有两年,通过架构创新,已经大幅提高了开发效率和科学计算性能。近日,基于全场景AI框架昇思MindSpore开发的蛋白质结构预测模型在全球持续蛋白质结构预测竞赛CAMEO(Continous Automated Model EvaluatiOn)上连续三周霸榜,并包揽月榜前二,显示出昇腾AI基础软硬件平台在科学计算AI领域的强大能力。

      由瑞士生物信息研究所和巴塞尔大学联合举办的 CAMEO(Continous Automated Model EvaluatiOn)——全球持续蛋白质结构预测竞赛,被认为是蛋白质结构预测领域最重要的比赛之一。

      CAMEO 竞赛的规则是,每位参赛者需每周对 20 个由世界范围内的结构生物学家最新破解出的蛋白质结构进行预测,其分数和名次每周都会进行在线更新。因此,该竞赛吸引来不少世界范围内生物计算领域的前沿模型“选手”。

      据了解,2021年11月,昇思MindSpore团队与昌平实验室、北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)和化学与分子工程学院、深圳湾实验室高毅勤教授课题组联合推出基于AlphaFold2算法的蛋白质结构预测推理工具,并在2022年2月实现训练的全流程打通,效率同比提升2-3倍。

      采用昇腾AI基础软硬件平台后,在混合精度下,单步迭代时间由20秒缩短到12秒,性能提升超过60%。依托昇思MindSpore内存复用能力, 训练序列长度由384提升至512。

      在训练精度接近AlphaFold2的基础上,昇思MindSpore在算法、规模和软硬件支持等方向上持续改进,本次发布的蛋白质结构预测模型成绩持续刷新业界记录、拿下CAMEO竞赛第一,是昇思MindSpore在蛋白质结构预测领域的又一里程碑,在填补AI根技术在蛋白质结构预测领域成绩空白的同时,更加证明了其价值与优越性。

      据华为方面透露,未来,针对蛋白质结构预测问题,昇思MindSpore将携手学术科研界,在蛋白质结构预测领域共同探索、持续突破,助力国内相关基础研究,尤其是生命各分支学科的进步,推动创新制药行业的发展。

    (责任编辑:王婉莹)

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    昇思MindSpore蛋白质结构预测模型全球竞赛第一

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